药智数据库双子星之药物合成数据库&合成图谱 独家报道
来源:药智网/ 药王steven 时间:2017-12-06 评论: 0 阅读: 1264 A+ A-
导读

您是否为了检索药物合成路线忙着找期刊、找论文、找专利?好不容易找到资料,却因埋头苦读耗费大量时间?终于搞清楚一篇文献的合成细节却清楚有没有其他更好的方法?费尽力气解决了这些问题之后还要再去联系供应商?今天,小编带您了解药智网特色数据库之一的药物合成数据库及其可视化工具——合成图谱,助您方便、快捷地解...

您是否为了检索药物合成路线忙着找期刊、找论文、找专利?好不容易找到资料,却因埋头苦读耗费大量时间?终于搞清楚一篇文献的合成细节却清楚有没有其他更好的方法?费尽力气解决了这些问题之后还要再去联系供应商?今天,小编带您了解药智网特色数据库之一的药物合成数据库及其可视化工具——合成图谱,助您方便、快捷地解决这些困扰。


收录产品


药物合成数据库收录了七千余个原料药的合成路线及中间体,信息来源于SCI优秀期刊和国内外权威专家著作。包含了当今世界上广泛使用的产品和热门新药。


提供的信息


(I)原料药、路线中间体的基本化学信息

(II)原料药的治疗类别及原研商

(III)合成路线所引参考文献

(IV)产品供应商

(V)清晰直观的可视化界面


适用群体


原料药研发人员、药品信息调研人员、高校师生、医药中间体生产企业、有机化学品销售员


入口及界面


图片2.png


药物合成数据库



合成图谱


图片3.png


数据库亮点&使用方法简介


A)药物合成数据库


本数据库为原料药、中间体各提供了四个检索框,默认的检索方式为非精确查询,即以使用者在检索框中输入信息作为子串在数据库的相应字段查找。非精确查询可以无遗漏的展示查找结果,推荐此种方式。如果所得结果过多,可以选中“精确查询”然后点击“搜索”按钮以缩小范围。


B)合成图谱


本数据库为原料药、中间体各提供了三个检索框。向检索框中输入检索条件的过程中,会不断弹出提示信息,点击您需要的条件即可在右侧空白区域内显示化合物的关联图。图谱中的箭头表示了两个化合物在某一反应中的关系,被箭头指向的是产物,引出箭头的是反应物。勾选“显示文字”选框可显示图中化合物的编号。


合成图谱数据库为动图设置了四种可变参数,默认值为(线条宽度:2;线条长度:100;作用力:-1000;半径:10),每次手动修改参数后需点击“设置”按钮方能生效。其中,作用力的数值越小,视图中的结点越倾向于相互靠近;作用力的数值越大,视图中的结点越倾向于相互远离。


视图中在结点上右击可弹出菜单,点击菜单中的选项可以查看其在“药物合成数据库”中的页面,可以固定/取消固定结点。


点击“清空视图”可清除视图显示区的所有内容。


以奥美拉唑为例


合成图谱是对药物合成数据库(以下简称“合成库”)的可视化展示,通过后台数据关联可以展示单个合成库详情页无法展示的共用中间体及中间体的上游化合物。两者共用同一个数据库的数据。以下用合成库来检索奥美拉唑:


图片4.png


图1


在合成库搜索栏里输入“Omeprazole”,点击“搜索”后得到图1所示的列表页界面,点击“合成方法”栏的“查看”链接可打开详情页(如图2所示);若点击“合成路线挖掘”栏的“查看”可打开该产品的合成图谱页面。


图片5.png


图2


合成库详情页可分为四个区域,最下方的“扩展信息”提供了详情页产品跳转到其他数据库的链接标签。目前,合成库已与国产药品数据库、进口药品数据库、美国FDA橙皮书数据库、美国DMF注册数据库、欧盟上市药品信息库、药物NCE原始专利库等实现了双向关联,让您在浏览时快速查看多方面信息。


合成图谱检索奥美拉唑、埃索美拉唑:


图片6.png


图3


如图3所示,在左侧“品名”检索框中分别输入“Omeprazole”和“Esomeprazole”,二者谱图共同显示在右侧展示区内,黄色结点为原料药,红色结点为二者共同中间体。


合成图谱中6位编号的为原料药,5位编号的为中间体,右击结点后的菜单中点击“详细信息”选项可查看其在合成库中的路线。右击图中原料药结点(6位编号的)可弹出菜单,查看合成库中该原料药的合成路线;右击图中中间体结点(5位编号的),可查看合成库中该中间体参与的合成路线。



结语


今天小编就带大家了解到这里。如果您有好的意见或建议,可加QQ:3505287319交流,我们会以最大的热情不断优化服务,给您更好的使用体验。


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药品注册与受理数据库查询
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