OpenEye分子对接、基于分子形状的虚拟筛选、AI算法联用

导读:OpenEye的分子对接(Fred,Hybrid,Posit)工具在计算化学领域中独树一帜

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图片来源:源资科技


OpenEye的分子对接(Fred,Hybrid,Posit)工具在计算化学领域中独树一帜,通过结合形状匹配和传统的化学相互作用分析,实现了分子对接的高效性和准确性。这种双重筛选机制先利用形状相似性进行快速筛选,缩小候选分子范围,随后通过精细的化学分析深入探索分子与靶点的结合模式,极大提升了药物发现和分子设计的成功率和速度。

OpenEye的ROCS模块是一种高级的虚拟筛选工具,专门用于通过形状相似性评估化合物的匹配度。ROCS不仅能分析分子的三维形状,还可以考虑分子表面的化学特性,更准确地评估药物分子功能相似性。这使得ROCS成为寻找与已知活性分子具有相似结构特征的潜在药物候选分子的理想工具,广泛应用于药物设计和化学研究中的结构导向分析。

讲座主要内容

1、OpenEye分子对接操作流程

(0.47s/mol,笔记本,i7-1255U,10核12线程)

相关资料、数据获取

蛋白准备及注意事项

受体准备及注意事项

基于蛋白信息的分子对接

基于蛋白-受体信息的分子对接

2、基于活性药物分子结构(无需受体蛋白)的虚拟筛选(ROCS)

活性化合物确认

活性化合物准备

虚拟库准备

基于活性化合物的虚拟筛选

3、ROCS/AI算法联用

ROCS对药物活性影响相关性分析

机器学习/深度学习算法联用


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责任编辑:白芨


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